南京市中医院（南京中医药大学附属南京中医院、南京市中医药研究所）成立于1956年，现有1个主院区（大明路院区）、1个分院区（城南分院），三个紧密合作型医联体：浦口分院（南京市浦口区中医院）、高淳分院（南京市高淳中医院）、滨海分院（盐城市滨海县中医院），是新中国成立最早的中医医院之一，发展到现在已是一所中医特色明显，集医疗、教学、科研、预防保健、康复和急救功能为一体的、具有中国传统文化特色的花园式、现代化大型三级甲等中医院，是全国肛肠医疗中心、国家级区域诊疗中心。