病毒性肝炎的治疗包括多个方面，保肝抗纤维化、抗病毒、去除病因、预防肝癌等。其中以针对不同病因，并去除病因，治疗病毒性肝炎的最重要原则，病毒性肝炎携带者需要定期体检复查，通常不需要治疗。保肝治疗药物，治疗种类比较多，包括甘草酸钠技术类制剂。适用于所有慢性肝炎的病人。
抗纤维化治疗多为中成药口服制剂，也适用于所有慢性肝炎的病人，d3注射干扰素，抗病毒治疗包括普通干扰素和聚乙二醇化干扰素，是用于慢性乙型肝炎、急慢性丙型肝炎患者。疗程至少一年，干扰素联合利巴韦林是慢性丙型肝炎的标准治疗方案。疗效取决于丙肝基因分裂以及对治疗的应答，一周内出现丙肝病毒低于检测限者俗称有快速应答。大部分人群对干扰素治疗效果好，痊愈率达87%。
口服和甘类药物抗病毒治疗，药物用于治疗乙型肝炎，包括慢性乙型肝炎和肝硬化患者。在中国大陆有以下四种药物，拉米夫定、夫唯只替、比夫定、恩替卡韦。国际上还有第五种药物用于治疗，对于上市的药物耐受的患者，和其他药物相比的优点是，抗病毒疗效好，副作用小，且服用方便，每日一片，在临床上得到广泛的应用。免疫抑制剂，抑制剂可以辅助治疗肝炎患者。预防肿瘤的发生，降低慢性肝炎发生肝癌的几率，增加补充微量硒元素。还可注射胸腺肽提高免疫力，停止服用肝损伤药物也是有很重要意义的。
