炎症深入黏膜固有膜时影响胃腺体,使之萎缩,称萎缩性胃炎。胃黏膜层变薄,黏膜皱襞平坦或消失,可为弥漫性,也可呈局限性。镜下见胃腺体部分消失,个别者可完全消失,黏膜层、黏膜下层有淋巴细胞和浆细胞浸润。有时黏膜萎缩可并发胃小凹上皮细胞增生,致使局部黏膜层反而变厚,称萎缩性胃炎伴过形成。如炎症蔓延广泛,破坏大量腺体,使整个胃体黏膜萎缩变薄,称胃萎缩。 萎缩性胃炎可发生肠腺上皮化生和假性幽门腺化生,在增生的胃小凹和肠化上皮的基础上可发生异型增生。异型增生是一种不正常粘膜,具有不典型细胞、分化不良和黏膜结构紊乱的特点,认为极可能是癌前病变。

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